填写参数(时空)

温馨提示:
  • 需确保Barcode文件符合要求,且Barcode文件中的序列长度需和Barcode的读长设置保持一致,具体信息请参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南

  • 时空可视化试剂套装仅支持单barcode测序。

  1. 填写运行名称。

    注意:
    • 此字段必须填写,是与测序样本绑定的唯一固定标识。

    • 该内容不可包含特殊字符,否则无法执行下一步操作。

  2. 选择样本类型:

    注意:

    对于时空测序,【样本类型】字段仅代表制备DNB的方式,与真实投入的样本类型无关。

    • 如用测序仪制备DNB,勾选【ssDNA】

    • 如手工制备DNB,勾选【DNB】

  3. 确保【应用类型】信息框显示【STO】。在装载耗材界面装载完DNBSEQ-T7+RS时空可视化试剂盒中测序试剂槽后,【应用类型】信息框会根据输入的的测序试剂槽ID信息自动显示【STO】

  4. 点击【测序方案】信息框的G004281,选择【创建测序方案】,按照下图信息创建自定义测序方案,点击【保存】

    • 对于FFPE V1.0文库,【一链】读长设置为【25】【二链】读长设置为【62】【Barcode】读长设置为【10】【二链】暗反应Cycle设置为【7~9】

      图 1. FFPE V1.0文库测序方案设置
      G010994

    • 对于FFPE V1.1文库、FF V1.3文库、或CITE V1.1-cDNA与CITE V1.1-ADT pooling文库,【一链】读长设置为【50】【二链】读长设置为【100】【Barcode】读长设置为【10】【一链】暗反应Cycle设置为【26~40】

      图 2. FFPE V1.1文库或FF V1.3文库或CITE V1.1-cDNA与CITE V1.1-ADT pooling文库测序方案设置
      G010995

  5. 点击【Barcode】信息框的G004281,选择对应的Barcode序列。

    如需自定义Barcode序列,点击【上传Barcode文件】,导入自定义Barcode序列文件。具体操作,参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南

  6. 选择是否拆分Barcode。

    时空文库为单Barcode文库,如需拆分,勾选【Barcode】

  7. (可选)在【DNB/文库ID】文本框中填写DNB/文库ID。

  8. 设置测序结束后是否进行自动清洗。

    【下机自动清洗】:默认为【是】。如选择【否】,则测序结束后需进行手动清洗。

  9. 设置测序结束后进行远程分析或闲时分析。

    • 【远程分析】:测序结束后启动远程分析。

    • 【闲时分析】:测序结束后启动闲时分析。

      • 关于闲时分析的详情,参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南

      • 如勾选【写FASTQ】,需同时选择【标准过滤】

        • 【标准过滤】:表示使用默认过滤参数,获得符合质量和产量要求的数据。

        • 【高产量过滤】:预留。

  10. 点击【下一步】,进入信息回顾界面。