填写参数(时空)
需确保Barcode文件符合要求,且Barcode文件中的序列长度需和Barcode的读长设置保持一致,具体信息请参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南。
时空可视化试剂套装仅支持单barcode测序。
填写运行名称。
注意:此字段必须填写,是与测序样本绑定的唯一固定标识。
该内容不可包含特殊字符,否则无法执行下一步操作。
选择样本类型:
注意:对于时空测序,【样本类型】字段仅代表制备DNB的方式,与真实投入的样本类型无关。
如用测序仪制备DNB,勾选【ssDNA】。
如手工制备DNB,勾选【DNB】。
确保【应用类型】信息框显示【STO】。在装载耗材界面装载完DNBSEQ-T7+RS时空可视化试剂盒中测序试剂槽后,【应用类型】信息框会根据输入的的测序试剂槽ID信息自动显示【STO】。
点击【测序方案】信息框的
,选择【创建测序方案】,按照下图信息创建自定义测序方案,点击【保存】。
对于FFPE V1.0文库,【一链】读长设置为【25】,【二链】读长设置为【62】,【Barcode】读长设置为【10】,【二链】暗反应Cycle设置为【7~9】。
图 1. FFPE V1.0文库测序方案设置 对于FFPE V1.1文库、FF V1.3文库、或CITE V1.1-cDNA与CITE V1.1-ADT pooling文库,【一链】读长设置为【50】,【二链】读长设置为【100】,【Barcode】读长设置为【10】,【一链】暗反应Cycle设置为【26~40】。
图 2. FFPE V1.1文库或FF V1.3文库或CITE V1.1-cDNA与CITE V1.1-ADT pooling文库测序方案设置
点击【Barcode】信息框的
,选择对应的Barcode序列。
如需自定义Barcode序列,点击【上传Barcode文件】,导入自定义Barcode序列文件。具体操作,参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南。
选择是否拆分Barcode。
时空文库为单Barcode文库,如需拆分,勾选【Barcode】。
(可选)在【DNB/文库ID】文本框中填写DNB/文库ID。
设置测序结束后是否进行自动清洗。
【下机自动清洗】:默认为【是】。如选择【否】,则测序结束后需进行手动清洗。
设置测序结束后进行远程分析或闲时分析。
【远程分析】:测序结束后启动远程分析。
【闲时分析】:测序结束后启动闲时分析。
关于闲时分析的详情,参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南。
如勾选【写FASTQ】,需同时选择【标准过滤】。
【标准过滤】:表示使用默认过滤参数,获得符合质量和产量要求的数据。
【高产量过滤】:预留。
点击【下一步】,进入信息回顾界面。