文库插入片段大小要求
时空可视化试剂套装适用于时空转录组FF V1.3文库、时空转录组FFPE V1.0&V1.1文库、时空蛋白转录组CITE V1.1-cDNA文库和抗体衍生标签CITE V1.1-ADT文库,文库为双链DNA。
FFPE V1.0文库插入片段范围在150 bp~1000 bp,同时主带集中在±100 bp以内。
FFPE V1.1文库插入片段范围在200 bp~1000 bp,同时主带集中在±100 bp以内。
FF V1.3文库和CITE V1.1-cDNA文库的插入片段范围在200 bp~600 bp,同时主带集中在±100 bp以内。
CITE V1.1-ADT文库插入片段范围在200~260 bp。
高通量测序试剂套装适用于华大智造提供的建库试剂盒所构建的文库或者标准文库。文库插入片段范围建议在200 bp~500 bp,同时主带集中在±100 bp以内。如需使用TruSeq或Nextera建库试剂盒所构建的文库,建议使用如下文库转化试剂盒:
| 试剂盒名称 | 规格 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MGIEasy 通用文库转换试剂盒(App-A) | 16 RXN | MGI | 1000004155 |
| MGIEasy App文库环化试剂盒 | 16 RXN | MGI | 940-000915-00 |
| 型号 | 理想文库插入片段大小(bp) | 应用 |
|---|---|---|
| T7+ FCL PE100 | 200~400 | WGS、WES、WGBS、RNAseq 等 |
| T7+ App-D FCL PE100 | ||
| T7+ FCL PE150 | 300~500 | |
| T7+ App-D FCL PE150 | ||
| T7+ STO FCL PE75 | 150~1000 | FFPE V1.0 |
| 200~1000 | FFPE V1.1 | |
| 200~600 | FF V1.3 | |
| CITE V1.1-cDNA | ||
| 200~260 | CITE V1.1-ADT |
具体选择的试剂套装,可综合考虑片段大小和所需数据量。
如建库试剂盒的说明书有特殊需求,则以建库试剂盒说明书的片段要求为准。
如文库插入片段在推荐范围外,可能影响测序数据产出。
如文库插入片段小于测序的单端读长,可在自定义测序方案时,将【提前测Barcode】设置为【Yes】以提高数据产出,具体操作,参考DNBSEQ-T7+RS 基因测序仪系统操作指南。