ssDNA pooling

根据不同样本测序时所需的数据量,将各样本的ssDNA进行混合。

温馨提示:
  • 本节所述的ssDNA文库已经过环化、消化和纯化。

  • c表示文库浓度(fmol/μL)。

  • 当常规PCR文库及PCR-free文库的单张载片总投入量在480 fmol~600 fmol时,可风险上机,低于此投入量要求时,不建议上机。

  • 下表最后一列中的WGBS文库需使用MGIEasy 全基因组甲基化文库制备试剂盒(货号:940-001530-00)构建,以便达到以下目标测序数据量产出比例:

    WGSPCRWGBS=1

    此时,WGS PCR建库试剂盒无品牌限制。但是,使用其他品牌试剂盒构建时,WGBS文库与WGS PCR文库pooling比例需自行摸索。

ssDNA文库pooling数说明

文库类型

测序数据量

文库投入体积 V(μL)

投入量要求

常规PCR

单一文库

V=600fmol960fmolc

600 fmol/载片~960 fmol/载片

常规 PCR-free

WGBS

单一文库

V=960fmolc

960 fmol/载片

WGS PCR和PCR-free

WGSPCRWGSPCRfree=1

仅示例:V1WGSPCR=300fmolcV2WGSPCRfree=300fmolcV=V1+V2

WGSPCRWGSPCRfree=1

WGS PCR和WGBS

WGSPCRWGBS=1

仅示例:V1WGSPCR=300fmolcV2WGBS=300fmolc×2V=V1+V2

WGSPCRWGBS=12