制备DNB

  1. 取出0.2 mL八联管或PCR管,按照下表配制时空DNB制备反应混合液1:

    时空DNB制备反应混合液1

    组分

    管盖颜色

    体积(μL)

    90 μL体系

    45 μL体系

    TE缓冲液

    G001944

    20-V

    10-V

    时空组学DNB制备缓冲液

    G001946

    20

    10

    dsDNA文库

    /

    V

    V

    总体积(μL)

    40

    20

  2. 将时空DNB制备反应混合液1用涡旋振荡器振荡混匀,迷你离心机离心5 s,置于PCR仪中进行引物杂交,反应条件见下表:

    DNB制备引物杂交反应条件

    温度

    时间

    105 ℃(热盖)

    On

    95 ℃

    3 min

    程序反应结束后立即将样本置于冰上,放置2 min

  3. 取出DNB聚合酶混合液Ⅱ(OS-V4.0),短暂离心5 s,置于冰上备用。

    注意:

    DNB聚合酶混合液Ⅱ(OS-V4.0)需在冰上操作,勿置于室温。使用时需握住试剂管顶部,勿触碰管壁。手掌温度或室温可能会影响酶的活性。

  4. 装有时空DNB制备反应混合液1的PCR管冷却后,使用迷你离心机离心5 s,在冰上将下表列出的试剂加入管中,制备时空DNB制备反应混合液2:

    时空DNB制备反应混合液2

    组分

    管盖颜色

    体积(μL)

    90 μL体系

    45 μL体系

    DNB聚合酶混合液Ⅰ(OS-V4.0)

    G001951

    40

    20

    DNB聚合酶混合液Ⅱ(OS-V4.0)

    G002256

    2

    1

    总体积(μL)

    42

    21

  5. 用涡旋振荡器振荡混匀,迷你离心机离心5 s,即刻置于PCR仪中,反应条件如下:

    温馨提示:
    • 部分品牌的PCR仪的热盖升降温速度慢。在热盖升降温过程中,加热模块处于室温状态,且程序未运行。对于这种类型的PCR仪,需提前进行热盖预热,确保在进行DNB反应时热盖处于工作温度。

    • 热盖温度建议设置为35 ℃,或尽可能设置成接近35 ℃的最低温度。

    DNB制备滚环扩增条件

    温度

    时间

    35 ℃ (热盖)

    On

    30 ℃

    20 min

    4 ℃

    Hold

  6. 当PCR仪温度达到4 ℃后立即取出PCR管置于冰上,加入5 μL DNB终止缓冲液(45 μL体系) 或10 μL DNB终止缓冲液(90 μL体系),用无滤芯的阔口吸头缓慢吹打混匀8次。完成后立即测定DNB浓度,并尽快上机测序。

    注意:
    • 操作过程中,务必将DNB置于冰上。

    • 务必使用阔口吸头(不带滤芯)缓慢吹打混匀DNB。切勿离心、振荡及剧烈吹打。

    • 制备完成的DNB需置于2 ℃~8 ℃。