计算dsDNA文库所需量
一个插件试剂盒1的DNB制备试剂支持制备10管90 μL体系的DNB,或20管45 μL体系的DNB。
一张测序载片需加载的DNB体积为348 μL。
根据样本的种类,每个样本的测序所需的数据量决定DNB制备体系的体积量。
对于一张测序载片,样本A所需的数据量为a,pooling文库的总数据量为b,样本A所需的理论DNB体积为:
制备体系为90 μL时,样本A的DNB制备体系个数为:(VDNB/90),取整数+1。
制备体系为45 μL时,样本A的DNB制备体系个数为:(VDNB/45),取整数+1。
根据 时空文库浓度要求 所测得的时空初始dsDNA文库浓度及所需的文库fmol量,计算每个DNB制备体系所需投入的dsDNA文库体积。下表为1个DNB制备体系所需的dsDNA文库体积:
| 文库类型 | 文库体积V(μL) | ||
|---|---|---|---|
| 90 μL体系 | 45 μL体系 | ||
| FFPE V1.0 dsDNA | 120 ng/c | 60 ng/c | |
| FFPE V1.1 dsDNA | 400 fmol/c~650 fmol/c | 200 fmol/c~325 fmol/c | |
| FF V1.3 dsDNA | |||
| CITE V1.1-cDNA dsDNA | |||
| CITE V1.1-ADT dsDNA | |||
温馨提示:
c表示文库浓度(fmol/μL)或者(ng/μL)
如建库试剂盒说明书有特殊要求,则以建库试剂盒说明书的文库要求为准。
计算出的文库体积V填入 制备DNB 。